Имя известного архитектора М.К. Геппенера овеяно множеством тайн. Будучи автором многих московских строений самого разного назначения (большинство из которых уже не сохранились), Геппенер, по слухам, являлся членом масонской ложи. В XX веке многие здания, построенные им, были разрушены – и каждый раз в стенах находили какие-то странные артефакты, а интерьер или фасады зачастую украшала загадочная символика. Не является исключением и здание РХТУ имени Менделеева на Миуссах. По принятой архитекторами-масонами традиции при закладке здания Московского промышленного училища, будущего РХТУ, в его фундамент были вмурованы символические инструменты «вольных каменщиков».
Сама архитектура здания также изобилует многими интересными фактами и тайнами. Толщина стен – не менее полутора метров. Освещается все пространство стилизованными под факелы бронзовыми светильниками.
На нескольких уровнях под землей расположены огромные пространства подвалов – система прямых и перпендикулярных коридоров и комнат.
Среди студентов РХТУ ходит легенда про до сих пор сохранившийся ход под землей, который соединял когда-то здание Московского промышленного училища с разрушенным большевиками собором Св. Александра Невского. Есть также сведения о том, что все постройки Миусской площади того периода были связаны между собой единой системой подземных коммуникаций, интегрированной в густую сеть старинных московских подземелий.
По одной из легенд, здание Московского промышленного училища строилось не только как учебное заведение, но и место тайных сборов для масонской ложи «Астрея» (в помещении нынешнего зала имени Бородина, или Малого актового зала). Первый директор училища (он же председатель строительной комиссии) А.А. Крылов входил в «Астрею», равно как и третий директор (в период с 1902 по 1911 г.), Александр Петрович Докторов, собственно, принявший это здание в эксплуатацию в 1903 году.